Η αρχή λειτουργίας της πλατφόρμας NGS βασίζεται στην τεχνολογία Ion AmpliseqΤΜ η οποία επιτρέπει την ανάλυση ακόμα και πολύ μικρής ποσότητας DNA γεγονός που εξασφαλίζει την ολοκλήρωση της εξέτασης ακόμα και από πολύ απαιτητικά δείγματα (FFPE,Laser Capture Microdissected).
Η πλατφόρμα Ion S5 XLTM αξιοποιεί την ταχύτητα του semiconductor sequencing για να επιτρέψει την παραγωγή δεδομένων αλληλουχίας υψηλής ποιότητας σε λίγες ώρες και δίνει τη δυνατότητα να μετάβασης από τη βιβλιοθήκη DNA σε δεδομένα σε μόλις 24 ώρες.